研究者の方へ

研究者の方へ

sp content nav HMTの発表論文・総説

CE-MSメタボロミクス論文DB

  • 医歯薬
  • 栄養・食品
  • 植物
  • 化学・環境
  • 醗酵・生産
  • 化粧品・香料
医歯薬学分野の論文一覧
Structural basis for amino acid export by DMT superfamily transporter YddG.
Tsuchiya H, Doki S, Takemoto M, Ikuta T, Higuchi T, Fukui K, Usuda Y, Tabuchi E, Nagatoishi S, Tsumoto K, Nishizawa T, Ito K, Dohmae N, Ishitani R, Nureki O Nature, : , 2016

DMTスーパーファミリー輸送体YddGの立体構造を解いてアミノ酸輸送機構を明らかにした。

アミノ酸ベーシックスキャン輸送体
Tumour-specific metabolic adaptation to acidosis is coupled to epigenetic stability in osteosarcoma cells.
Chano T, Avnet S, Kusuzaki K, Bonuccelli G, Sonveaux P, Rotili D, Mai A, Baldini N. Am J Cancer Res, : , 2016

酸性環境の悪性細胞は代謝的にミトコンドリアへenergy shiftするのとともに、epigeneticにmethyl化状態を維持しやすい代謝環境となる。

ベーシックスキャン
Metabolic analysis of antibody producing Chinese hamster ovary cell culture under different stresses conditions.
Badsha MB, Kurata H, Onitsuka M, Oga T, Omasa T. J Biosci Bioeng., : , 2016
培養細胞による抗体産生で生産性の違いを代謝モデルで解析した
シー・スコープ培養細胞抗体
Cerebrospinal fluid metabolomics identifies a key role of isocitrate dehydrogenase in bipolar disorder: evidence in support of mitochondrial dysfunction hypothesis.
Yoshimi N, Futamura T, Bergen SE, Iwayama Y, Ishima T, Sellgren C, Ekman CJ, Jakobsson J, Pålsson E, Kakumoto K, Ohgi Y, Yoshikawa T, Landén M, Hashimoto K. Mol Psychiatry., : , 2016
双極性障害におけるイソクエン酸脱水素酵素(ICDH)の主要な役割を明らかにした
CSFシー・スコープラット精神疾患
Metabolome analyses uncovered a novel inhibitory effect of acyclic retinoid on aberrant lipogenesis in a mouse diethylnitrosamine-induced hepatic tumorigenesis model.
Qin XY, Tatsukawa H, Hitomi K, Shirakami Y, Ishibashi N, Shimizu M, Moriwaki H, Kojima S Cancer Prev Res (Phila)., : , 2016
非環式レチノイドの抗がんメカニズムの解明
がんデュアルスキャン先導助成組織
Metabolic analysis of canine peripheral blood mononuclear cells treated ex vivo with dexamethasone.
Nozawa S, Sato T, Katayama K, Ishioka K, Sako T, Arai T, Tazaki H. Vet J., 207: 184–187, 2015
デキサメサゾンの添加は、培養犬末梢血単核球におけるグルコースの異化/同化バランスを同化傾向に向かわせる
ベーシックスキャン糖尿病
Comprehensive analysis of transcriptome and metabolome analysis in Intrahepatic Cholangiocarcinoma and Hepatocellular Carcinoma.
Yoshiki Murakami, Shoji Kubo, Akihiro Tamori, Saori Itami, Etsushi Kawamura, Keiko Iwaisako, Kazuo Ikeda, Norifumi Kawada, Takahiro Ochiya, Y-h Taguchi. Sci. Rep., 5: 16294, 2015

肝内胆管がんと肝細胞がんの転写産物と代謝産物の総合分析により、肝内胆管がんを判別するマーカー候補を見出した。

アドバンストスキャン肝臓
Hepatocyte β-Klotho regulates lipid homeostasis but not body weight in mice.
Kobayashi K, Tanaka T, Okada S, Morimoto Y, Matsumura S, Manio MC, Inoue K, Kimura K, Yagi T, Saito Y, Fushiki T, Inoue H, Matsumoto M, Nabeshima Y. FASEB J., 30(2): 849-62, 2016
肝細胞β-Klotho依存的胆汁酸合成制御は、脂質恒常性に必須であるが、体重制御には寄与しない
シー・スコープマウス血漿
Metabolomic Analysis of the Skeletal Muscle of Mice Overexpressing PGC-1α.
Hatazawa Y, Senoo N, Tadaishi M, Ogawa Y, Ezaki O, Kamei Y, Miura S. PLoS One., 10(6): e0129084, 2015
トランスジェニックマウスにおける骨格筋特異的な代謝の解析
マウス筋肉
Arginine-ornithine Antiporter ArcD Controls Arginine Metabolism and Interspecies Biofilm Development of Streptococcus gordonii.
Sakanaka A, Kuboniwa M, Takeuchi H, Hashino E, Amano A. J Biol Chem., 290(35): 21185-98, 2015
推定アルギニン/オルニチンアンチポーターの遺伝子欠損株ではオルニチンが細胞内で蓄積されることにより、アルギニンデイミナーゼシステムの機能不全とデノボのアルギニン生合成が抑制されることを明らかにした
バクテリア
Metabolomic Analysis of Blood Plasma after Oral Administration of N-acetyl-d-Glucosamine in Dogs.
Osaki T, Kurozumi S, Sato K, Terashi T, Azuma K, Murahata Y, Tsuka T, Ito N, Imagawa T, Minami S, Okamoto Y. Mar Drugs., 13(8): 5007-15, 2015
N-アセチルグルコサミン-D-グルコサミン投与により血中エクトイン濃度を上昇させる
ベーシックスキャン血漿
Myocardial Energy Provision Is Preserved by Increased Utilization of Glucose and Ketone Bodies in CD36 Knockout Mice
Nakatani K, Watabe T, Masuda D, Imaizumi M, Shimosegawa E, Kobayashi T, Sairyo M, Zhu Y, Okada T, Kawase R, Nakaoka H, Naito A, Ohama T, Koseki M, Oka T, Akazawa H, Nishida M, Komuro I, Sakata Y, Hatazawa J, Yamashita S. Metabolism., 64(9): 1165-74, 2015
マウス心筋組織
Signaling through the Phosphatidylinositol 3-Kinase (PI3K)/Mammalian Target of Rapamycin (mTOR) Axis Is Responsible for Aerobic Glycolysis mediated by Glucose Transporter in Epidermal Growth Factor Receptor (EGFR)-mutated Lung Adenocarcinoma.
Makinoshima H, Takita M, Saruwatari K, Umemura S, Obata Y, Ishii G, Matsumoto S, Sugiyama E, Ochiai A, Abe R, Goto K, Esumi H, Tsuchihara K. J Biol Chem., 290(28): 17495-504, 2015
EGFR遺伝子変異肺線がん細胞においてPI3K/AKT/mTOR系のシグナル伝達は好気的解糖の調節に不可欠である
がんエフ・スコープシー・スコープ培養細胞
Retinoblastoma protein promotes oxidative phosphorylation through upregulation of glycolytic genes in oncogene-induced senescent cells.
Takebayashi S, Tanaka H, Hino S, Nakatsu Y, Igata T, Sakamoto A, Narita M, Nakao M Aging Cell., 14(4): 689-97, 2015
シー・スコープ
SHMT2 drives glioma cell survival in ischaemia but imposes a dependence on glycine clearance.
Kim D, Fiske BP, Birsoy K, Freinkman E, Kami K, Possemato RL, Chudnovsky Y, Pacold ME, Chen WW, Cantor JR, Shelton LM, Gui DY, Kwon M, Ramkissoon SH, Ligon KL, Kang SW, Snuderl M, Vander Heiden MG, Sabatini DM. Nature., 520(7547): 363-7, 2015
セリンからグリシンを生成するSHMT2およびグリシン分解酵素であるGLDCが、低酸素環境におけるがん(特にグリオーマ)細胞の生存に重要であることを明らかにした
がんシー・スコープ
Manual therapy ameliorates delayed-onset muscle soreness and alters muscle metabolites in rats.
Urakawa S, Takamoto K, Nakamura T, Sakai S, Matsuda T, Taguchi T, Mizumura K, Ono T, Nishijo H. Physiol Rep., 3(2): e12279, 2015
用手療法は遅発性筋肉痛を改善し、筋肉の代謝プロファイルを変化する
ベーシックスキャンラット筋肉
DNA methyltransferase 3a regulates osteoclast differentiation by coupling to an S-adenosylmethionine–producing metabolic pathway
Nishikawa K, Iwamoto Y, Kobayashi Y, Katsuoka F, Kawaguchi SI, Tsujita T, Nakamura T, Kato S, Yamamoto M, Takayanagi H, Ishii M. Nat Med., 21(3): 281-7, 2015
細胞の運命決定・機能変化には、その細胞が置かれている代謝状態が関与することを初めて示した
シー・スコープ免疫破骨細胞
Antimicrobial peptide FF/CAP18 induces apoptotic cell death in HCT116 colon cancer cells via changes in the metabolic profile.
Kuroda K, Fukuda T, Isogai H, Okumura K, Krstic-Demonacos M, Isogai E Int J Oncol., 46(4): 1516-26, 2015
抗菌ペプチドFF/CAP18は、代謝プロファイルの変化を介し、HCT116結腸癌細胞におけるアポトーシス細胞死を誘導する
がんベーシックスキャン培地培養細胞
Lysine Demethylase LSD1 Coordinates Glycolytic and Mitochondrial Metabolism in Hepatocellular Carcinoma Cells.
Sakamoto A, Hino S, Nagaoka K, Anan K, Takase R, Matsumori H, Ojima H, Kanai Y, Arita K, Nakao M. Cancer Res., 75(7): 1445-56, 2015
リジン脱メチル化酵素LSD1が肝細胞がんのエネルギー代謝を変換する仕組みを新たに解明
がんエネルギー代謝ベーシックスキャン
Wheat Alkylresorcinols Suppress High-Fat, High-Sucrose Diet-Induced Obesity and Glucose Intolerance by Increasing Insulin Sensitivity and Cholesterol Excretion in Male Mice
Oishi K, Yamamoto S, Itoh N, Nakao R, Yasumoto Y, Tanaka K, Kikuchi Y, Fukudome S, Okita K, Takano-Ishikawa Y. J. Nutr., 145(2): 199-206, 2014
小麦ふすま由来アルキルレゾルシノールは、マウスの肝臓脂質蓄積および腸のコレステロール吸収を抑制して耐糖能とインスリン感受性を向上させることで食餌誘発性肥満を抑制する
マウス小麦糖尿病
Lysine-specific demethylase 2 suppresses lipid influx and metabolism in hepatic cells.
Nagaoka K, Hino S, Sakamoto A, Anan K, Takase R, Umehara T, Yokoyama S, Sasaki Y, Nakao M. Mol Cell Biol., 35(7): 1068-80, 2015
デュアルスキャン
Excessive degradation of adenine nucleotides by up-regulated AMP deaminase underlies afterload-induced diastolic dysfunction in the type 2 diabetic heart.
Kouzu H, Miki T, Tanno M, Kuno A, Yano T, Itoh T, Sato T, Sunaga D, Murase H, Tobisawa T, Ogasawara M, Ishikawa S, Miura T J Mol Cell Cardiol., 80: 136-45, 2015
高血圧による心室の硬化と心筋メタボロームプロファイルの関連
シー・スコープラット心不全心筋糖尿病
Reduced cerebrospinal fluid ethanolamine concentration in major depressive disorder.
Ogawa S, Hattori K, Sasayama D, Yokota Y, Matsumura R, Matsuo J, Ota M, Hori H, Teraishi T, Yoshida S, Noda T, Ohashi Y, Sato H, Higuchi T, Motohashi N, Kunugi H Sci Rep, 5: 7796, 2015
エタノールアミンは大うつ病患者のCSFで減少する
CSFヒト精神疾患
Regulation of 18F-FDG accumulation in colorectal cancer cells with mutated KRAS.
Iwamoto M, Kawada K, Nakamoto Y, Itatani Y, Inamoto S, Toda K, Kimura H, Sasazuki T, Shirasawa S, Okuyama H, Inoue M, Hasegawa S, Togashi K, Sakai Y J Nucl Med., 55(12): 2038-44, 2014
変異KRASが(18)F-FDGを蓄積するメカニズムの解明
がん培養細胞
Plasma and Liver Metabolic Profiles in Mice Subjected to Subchronic and Mild Social Defeat Stress.
Goto T, Kubota Y, Toyoda A J Proteome Res., 14(2): 1025-32, 2015
社会的ストレスが浸透圧調節および炎症に関連する代謝産物濃度に影響を与えている
ストレスベーシックスキャンマウス尿肝臓血液
Possible Contribution of Taurine to Distorted Glucagon Secretion in Intra-Islet Insulin Deficiency: A Metabolome Analysis Using a Novel α-Cell Model of Insulin-Deficient Diabetes.
Megumi Bessho, Yuko Murase-Mishiba mail, Akihisa Imagawa, Jungo Terasaki, Toshiaki Hanafusa PLoS One., 9(11): e113254, 2014
ベーシックスキャン培養細胞糖尿病
Sphingosine 1-phosphate lyase inhibition by 2-acetyl-4-(tetrahydroxybutyl)imidazole (THI) under conditions of vitamin B6 deficiency.
Ohtoyo M, Tamura M, Machinaga N, Muro F, Hashimoto R Mol Cell Biochem., 400(1-2): 125-33, 2015
アドバンストスキャン
Metabolomic analysis of the mechanism of isoflurane induced apoptosis of PC12 cells
Ando K, Urakami K, Kusuhara M, Tamai S, Morisaki H. Journal of Metabolomics, 1: 3, 2015
培養細胞酸化ストレス
Metabolomics of salivary fatigue markers in soccer players after consecutive games.
Ra SG, Maeda S, Higashino R, Imai T, Miyakawa S Appl Physiol Nutr Metab., 39(10): 1120-1126, 2014
サッカーの試合後の唾液メタボローム解析から疲労予測のためのマーカーを探索
スポーツヒトベーシックスキャン唾液
L-carnitine prevents progression of non-alcoholic steatohepatitis in a mouse model with upregulation of mitochondrial pathway.
Ishikawa H, Takaki A, Tsuzaki R, Yasunaka T, Koike K, Shimomura Y, Seki H, Matsushita H, Miyake Y, Ikeda F, Shiraha H, Nouso K, Yamamoto K PLoS One., 9(7): e100627, 2014
NASHにおけるカルニチンの進行抑制効果
NASHベーシックスキャンマウス組織肝臓
Epidermal growth factor receptor (EGFR) signaling regulates global metabolic pathways in EGFR-mutated lung adenocarcinoma.
Makinoshima H, Takita M, Matsumoto S, Yagishita A, Owada S, Esumi H, Tsuchihara K J Biol Chem., 289(30): 20813-23., 2014
EGFR阻害剤による代謝変化を解明
がんシー・スコープ培養細胞
Antipruritic effects of the probiotic strain LKM512 in adults with atopic dermatitis.
Matsumoto M, Ebata T, Hirooka J, Hosoya R, Inoue N, Itami S, Tsuji K, Yaginuma T, Muramatsu K, Nakamura A, Fujita A, Nagakura T Ann Allergy Asthma Immunol., 1206(14): 00300-7, 2014
医薬品の臨床試験の実施基準であるGCPに準拠した治験を行い、ビフィズス菌LKM512が成人型アトピー性皮膚炎の症状を改善することを確認
アレルギーヒトベーシックスキャン糞便腸内細菌
Glycolytic genes are targets of the nuclear receptor Ad4BP/SF-1.
Baba T, Otake H, Sato T, Miyabayashi K, Shishido Y, Wang CY, Shima Y, Kimura H, Yagi M, Ishihara Y, Hino S, Ogawa H, Nakao M, Yamazaki T, Kang D, Ohkawa Y, Suyama M, Chung BC, Morohashi K Nat Commun., 5: 3634, 2014
新規転写制御因子は解糖系酵素の活性制御に寄与している
ベーシックスキャンマルチオミクス培養細胞基礎科学
Prominent steatosis with hypermetabolism of the cell line permissive for years of infection with hepatitis C virus.
Sugiyama K, Ebinuma H, Nakamoto N, Sakasegawa N, Murakami Y, Chu PS, Usui S, Ishibashi Y, Wakayama Y, Taniki N, Murata H, Saito Y, Fukasawa M, Saito K, Yamagishi Y, Wakita T, Takaku H, Hibi T, Saito H, Kanai T PLoS One., 9(4): e94460, 2014
C型肝炎持続感染培養肝細胞を用いたC型肝炎肝脂肪蓄積における肝代謝異常の解明
デュアルスキャンマルチオミクス培養細胞肝炎
A snapshot of plasma metabolites in first-episode schizophrenia: a capillary electrophoresis time-of-flight mass spectrometry study.
Koike S, Bundo M, Iwamoto K, Suga M, Kuwabara H, Ohashi Y, Shinoda K, Takano Y, Iwashiro N, Satomura Y, Nagai T, Natsubori T, Tada M, Yamasue H, Kasai K Transl Psychiatry, 4: e379, 2014
代謝プロファイルの網羅的な解析による初回エピソード統合失調症のバイオマーカー探索
ベーシックスキャン先導助成精神疾患血液
Integrated genomic and functional analyses reveal glyoxalase I as a novel metabolic oncogene in human gastric cancer
F Hosoda, Y Arai, N Okada, H Shimizu, M Miyamoto, N Kitagawa, H Katai, H Taniguchi, K Yanagihara, I Imoto, J Inazawa, M Ohki and T Shibata Oncogene., 34(9): 1196-206, 2015
がんエネルギー代謝ベーシックスキャン培養細胞
Increased metabolite levels of glycolysis and pentose phosphate pathway in rabbit atherosclerotic arteries and hypoxic macrophage.
Yamashita A, Zhao Y, Matsuura Y, Yamasaki K, Moriguchi-Goto S, Sugita C, Iwakiri T, Okuyama N, Koshimoto C, Kawai K, Tamaki N, Zhao S, Kuge Y, Asada Y. PLoS One., 9(1): e86426, 2014
低酸素が引き起こす代謝変化
ウサギデュアルスキャンベーシックスキャン組織
Hsa-miR-520d induces hepatoma cells to form normal liver tissues via a stemness-mediated process.
Tsuno S, Wang X, Shomori K, Hasegawa J, Miura N Sci Rep., 4: 3852, 2014
Hsa-miR-520dは、幹細胞性が介在するメカニズムにより、肝がん細胞を正常肝組織へと形成誘導する
がんベーシックスキャン先導助成培養細胞
The effect of acyclic retinoid on the metabolomic profiles of hepatocytes and hepatocellular carcinoma cells.
Qin XY, Wei F, Tanokura M, Ishibashi N, Shimizu M, Moriwaki H, Kojima S PLoS One., 8(12): e82860, 2013
非環式レチノイドの抗がんメカニズムの解明
がんベーシックスキャン先導助成培養細胞
Plasma amino acids imbalance in cirrhotic patients disturbs the tricarboxylic acid cycle of dendritic cell
Kakazu E, Kondo Y, Kogure T, Ninomiya M, Kimura O, Ueno Y, Shimosegawa T Sci Rep., 3: 3459, 2013
血漿アミノ酸の不均衡が細胞内ATPを減少させることにより樹状細胞の成熟を抑制する
ベーシックスキャン培養細胞肝硬変
AICAR stimulation metabolome-widely mimics electrical contraction in isolated rat epitrochlearis muscle.
Miyamoto L, Egawa T, Oshima R, Kurogi E, Tomida Y, Tsuchiya K, Hayashi T Am J Physiol Cell Physiol., 305(12): C1214-22, 2013
ラット筋肉
Multi-faceted integrated omics analysis revealed parsley (Petroselinum crispum) as a novel dietary intervention in dextran sodium sulphate induced colitic mice.
Huijuan Jia, Wanping Aw, Manaka Hanate, Shoko Takahashi, Kenji Saito, Hiroshi Tanaka, Masaru Tomita, Hisanori Kato J. Func. Foods., 11: 438–448, 2014
シー・スコープパセリベーシックスキャンマウスマルチオミクス
Non-targeted human plasma metabolomics reveals the changes in oleoylethanolamide, a lipid-derived signaling molecule, by acute exposure of electric field.
Nakagawa-Yagi Y, Hara H, Fujimori T, Yamaguchi T, Midorikawa A, Hara A Integr Mol Med, 1(2): 29-37, 2014
デュアルスキャンバイオマーカーヒト血液
Erythritol alters microstructure and metabolomic profiles of biofilm composed of Streptococcus gordonii and Porphyromonas gingivalis.
Hashino E, Kuboniwa M, Alghamdi SA, Yamaguchi M, Yamamoto R, Cho H, Amano A Mol Oral Microbiol., 28(6): 435-51, 2013
高いバイオフィルム形成阻害効果を持つ糖アルコールのエリスリトールの阻害のメカニズムを解析
バクテリアベーシックスキャン
Vascularized and functional human liver from an iPSC-derived organ bud transplant.
Takebe T, Sekine K, Enomura M, Koike H, Kimura M, Ogaeri T, Zhang RR, Ueno Y, Zheng YW, Koike N, Aoyama S, Adachi Y, Taniguchi H Nature., 499(7459): 481-4, 2013
iPS細胞から形成した機能的肝組織の代謝プロファイル
iPS細胞ベーシックスキャンマルチオミクス
Obesity-induced gut microbial metabolite promotes liver cancer through senescence secretome.
Yoshimoto S, Loo TM, Atarashi K, Kanda H, Sato S, Oyadomari S, Iwakura Y, Oshima K, Morita H, Hattori M, Honda K, Ishikawa Y, Hara E, Ohtani N Nature., 499(7456): 97-101, 2013
肥満に伴う腸内細菌の変化が肝がんの発症を促進する
がんデュアルスキャンマウス肥満腸内細菌
Cerebral low-molecular metabolites influenced by intestinal microbiota: a pilot study.
Matsumoto M, Kibe R, Ooga T, Aiba Y, Sawaki E, Koga Y, Benno Y. Front. Syst. Neurosci., 7: 9, 2013
腸内常在菌が大脳の代謝系に大きな影響を与えている
ベーシックスキャンマウス腸内細菌
Metabolomic profiling of lung and prostate tumor tissues by capillary electrophoresis time-of-flight mass spectrometry.
Kenjiro Kami, Tamaki Fujimori, Hajime Sato, Mutsuko Sato, Hiroyuki Yamamoto, Yoshiaki Ohashi, Naoyuki Sugiyama, Yasushi Ishihama, Hiroko Onozuka, Atsushi Ochiai, Hiroyasu Esumi, Tomoyoshi Soga, Masaru Tomita Metabolomics, 9(2): 444-453, 2012
がん特異的な代謝の解明のため、同一の患者のがん部位と正常部位の組織を比較した
がんヒトベーシックスキャン組織
Leukemia cells demonstrate a different metabolic perturbation provoked by 2-deoxyglucose.
Miwa H, Shikami M, Goto M, Mizuno S, Takahashi M, Tsunekawa-Imai N, Ishikawa T, Mizutani M, Horio T, Gotou M, Yamamoto H, Wakabayashi M, Watarai M, Hanamura I, Imamura A, Mihara H, Nitta M. Oncol Rep., 29(5): 2053-7, 2013
解糖阻害に対する2種類の白血病細胞の反応の違いをメタボローム解析により明らかにした
エネルギー代謝シー・スコープ培養細胞
Homozygous and heterozygous GH transgenesis alters fatty acid composition and content in the liver of Amago salmon (Oncorhynchus masou ishikawae).
Sugiyama M, Takenaga F, Kitani Y, Yamamoto G, Okamoto H, Masaoka T, Araki K, Nagoya H, Mori T Biol Open, 1(10): 1035-42, 2012
成長ホルモンの遺伝子組換えによる肝臓の代謝への影響
マルチオミクス基礎科学肝臓魚介類
腸内細菌研究へのメタボローム解析の応用
松本光晴 分子消化器病, 10(4): 63-9, 2013
ベーシックスキャン
Metabolomic profiling rationalized pyruvate efficacy in cybrid cells harboring MELAS mitochondrial DNA mutations.
Kami K, Fujita Y, Igarashi S, Koike S, Sugawara S, Ikeda S, Sato N, Ito M, Tanaka M, Tomita M, Soga T Mitochondrion., 12(6): 644-53, 2012
エネルギー代謝エフ・スコープ
Nrf2 redirects glucose and glutamine into anabolic pathways in metabolic reprogramming.
Mitsuishi Y, Taguchi K, Kawatani Y, Shibata T, Nukiwa T, Aburatani H, Yamamoto M, Motohashi H Cancer Cell., 22(1): 66-79, 2012
がんエネルギー代謝基礎科学
Impact of Intestinal Microbiota on Intestinal Luminal Metabolome.
Matsumoto M, Kibe R, Ooga T, Aiba Y, Kurihara S, Sawaki E, Koga Y, Benno Y Sci Reports, 2: Article number:233, 2012
腸内常在菌の有無による腸内代謝プロファイルの違いを解析し、腸内常在菌が産生する物質の全貌を明らかにした
マウス基礎科学糞便腸内細菌
Remodeling of hepatic metabolism and hyperaminoacidemia in mice deficient in proglucagon-derived peptides.
Watanabe C, Seino Y, Miyahira H, Yamamoto M, Fukami A, Ozaki N, Takagishi Y, Sato J, Fukuwatari T, Shibata K, Oiso Y, Murata Y, Hayashi Y. Diabetes., 61(1): 74-84, 2012
ベーシックスキャンマウス肝臓
Metabolomic anatomy of an animal model revealing homeostatic imbalances in dyslipidaemia.
Ooga T, Sato H, Nagashima A, Sasaki K, Tomita M, Soga T, Ohashi Y Mol Biosyst., 7(4): 1217-23, 2011
脂質異常症モデル動物における全身性代謝異常のメタボローム解析
ウサギデュアルスキャン心臓肝臓血液
Adaptive Divergence in the Thyroid Hormone Signaling Pathway in the Stickleback Radiation.
Kitano J, Lema SC, Luckenbach JA, Mori S, Kawagishi Y, Kusakabe M, Suwanson P, Peichel CL Curr Biol., 20(23): 2124-2130, 2010
進化過程における生理学的現象と甲状腺ホルモン調節の関係
ホルモン基礎科学進化魚介類
Quantitative metabolome profiling of colon and stomach cancer microenvironment by capillary electrophoresis time-of-flight mass spectrometry.
Hirayama A, Kami K, Sugimoto M, Sugawara M, Toki N, Onozuka H, Kinoshita T, Saito N, Ochiai A, Tomita M, Esumi H, Soga T. Cancer Res., 69(11): 4918-25, 2009
大腸がんおよび胃がんの微小環境の定量的メタボロームプロファイリング
がんヒト
栄養・食品分野の論文一覧
Dynamic Metabolic Regulation by a Chromosome Segment from a Wild Relative During Fruit Development in a Tomato Introgression Line, IL8-3.
Ikeda H, Shibuya T, Imanishi S, Aso H, Nishiyama M, Kanayama Y. Plant Cell Physiol, : , 2016
トマトの果実形成過程における代謝産物と遺伝子発現の統合オミクス解析
Different Polar Metabolites and Protein Profiles between High- and Low-Quality Japanese Ginjo Sake
Takahashi K, Kohno H. PLoS One., 11(3): e0150524, 2016
吟醸酒品質の優劣により極性代謝物質とタンパク質プロファイルが異なる
ベーシックスキャン酒類
Effects of Oral Administration of Chitin Nanofiber on Plasma Metabolites and Gut Microorganisms.
Azuma K., Izumi R., Kawata M., Nagae T., Osaki T., Murahata Y., Tsuka T., Imagawa T., Ito N., Okamoto Y., Morimoto M., Izawa H., Saimoto H., Ifuku S. Int. J. Mol. Sci., 16(9): 21931-49, 2015
キチンナノファイバー経口摂取は腸管内の短鎖脂肪酸産生を促進し、全身のエネルギー産生、脂質代謝、セロトニン合成に影響を与える
デュアルスキャンマウス
Wheat Alkylresorcinols Suppress High-Fat, High-Sucrose Diet-Induced Obesity and Glucose Intolerance by Increasing Insulin Sensitivity and Cholesterol Excretion in Male Mice
Oishi K, Yamamoto S, Itoh N, Nakao R, Yasumoto Y, Tanaka K, Kikuchi Y, Fukudome S, Okita K, Takano-Ishikawa Y. J. Nutr., 145(2): 199-206, 2014
小麦ふすま由来アルキルレゾルシノールは、マウスの肝臓脂質蓄積および腸のコレステロール吸収を抑制して耐糖能とインスリン感受性を向上させることで食餌誘発性肥満を抑制する
マウス小麦糖尿病
Regulation of free glutamate content in meat by dietary lysine in broilers.
Watanabe G, Kobayashi H, Shibata M, Kubota M, Kadowaki M, Fujimura S Anim Sci J., 86(4): 435-42, 2015
短期的な高リジン食が鶏肉の食味を向上させる
ベーシックスキャン畜産筋肉
CE-TOF MS-based metabolomic profiling revealed characteristic metabolic pathways in postmortem porcine fast and slow type muscles.
Muroya S, Oe M, Nakajima I, Ojima K, Chikuni K Meat Sci., 98(4): 726-735, 2014
食肉(豚)の種類および年齢による代謝プロファイルの変化
ベーシックスキャン畜産筋肉
Antipruritic effects of the probiotic strain LKM512 in adults with atopic dermatitis.
Matsumoto M, Ebata T, Hirooka J, Hosoya R, Inoue N, Itami S, Tsuji K, Yaginuma T, Muramatsu K, Nakamura A, Fujita A, Nagakura T Ann Allergy Asthma Immunol., 1206(14): 00300-7, 2014
医薬品の臨床試験の実施基準であるGCPに準拠した治験を行い、ビフィズス菌LKM512が成人型アトピー性皮膚炎の症状を改善することを確認
アレルギーヒトベーシックスキャン糞便腸内細菌
Upregulation of colonic luminal polyamines produced by intestinal microbiota delays senescence in mice.
Kibe R, Kurihara S, Sakai Y, Suzuki H, Ooga T, Sawaki E, Muramatsu K, Nakamura A, Yamashita A, Kitada Y, Kakeyama M, Benno Y, Matsumoto M Sci Rep, 4: 4548, 2014
腸内細菌叢により産生される大腸内腔のポリアミン上昇は、マウスにおける老化を遅らせる
ヒトベーシックスキャンマウス糞便腸内細菌
An integrated multi-omics study revealed metabolic alterations underlying the effects of coffee consumption.
Takahashi S, Saito K, Jia H, Kato H PLoS One., 9(3): e91134, 2014
コーヒーの投与がマウス肝臓でのエネルギー生産を増加させたことをマルチオミクスで確認
ベーシックスキャンマウスマルチオミクス肝臓
Multi-faceted integrated omics analysis revealed parsley (Petroselinum crispum) as a novel dietary intervention in dextran sodium sulphate induced colitic mice.
Huijuan Jia, Wanping Aw, Manaka Hanate, Shoko Takahashi, Kenji Saito, Hiroshi Tanaka, Masaru Tomita, Hisanori Kato J. Func. Foods., 11: 438–448, 2014
シー・スコープパセリベーシックスキャンマウスマルチオミクス
植物分野の論文一覧
Dynamic Metabolic Regulation by a Chromosome Segment from a Wild Relative During Fruit Development in a Tomato Introgression Line, IL8-3.
Ikeda H, Shibuya T, Imanishi S, Aso H, Nishiyama M, Kanayama Y. Plant Cell Physiol, : , 2016
トマトの果実形成過程における代謝産物と遺伝子発現の統合オミクス解析
Seasonal induction of alternative principal pathway for rose flower scent
Hirata H, Ohnishi T, Tomida K, Ishida H, Kanda M, Sakai M, Yoshimura J, Suzuki H, Ishikawa T, Dohra H, Watanabe N. Sci Rep., 6: 20234, 2016
バラが2-フェニルエタノールを作り出す二つの経路を季節に応じてシフトさせることを明らかにした
バラ育種
Bacterial quorum sensing and metabolic slowing in a cooperative population.
An JH, Goo E, Kim H, Seo YS, Hwang I. Proc Natl Acad Sci U S A., 111(41): 14912-7, 2014
イネに感染するイネもみ枯細菌病菌(Burkholderia glumae)のクオラムセンシング(菌の生息密度によって、物質生産をコントロールする機構)と代謝の関連を明らかにした
バクテリア生産
Hormones, polyamines, and cell wall metabolism during oil palm fruit mesocarp development and ripening.
Teh HF, Neoh BK, Wong YC, Kwong QB, Ooi TE, Ng TL, Tiong SH, Low JY, Danial AD, Ersad MA, Kulaveerasingam H, Appleton DR J Agric Food Chem., 62(32): 8143-52, 2014
アブラヤシの果実に肥大にポリアミンの蓄積が関与している
アブラヤシベーシックスキャン生産
Study of polar metabolites in tobacco from different geographical origins by using capillary electrophoresis–mass spectrometry
Jieyu Zhao, Chunxiu Hu, Jun Zeng, Yanni Zhao, Junjie Zhang, Yuwei Chang, Lili Li, Chunxia Zhao, Xin Lu, Guowang Xu Metabolomics., 10(5): 805-815, 2014
タバコの葉の代謝プロファイリングから産地を識別できることを示した
タバコベーシックスキャン
Deficiency of autophagy leads to significant changes of metabolic profiles in Arabidopsis.
Izumi M, Hidema J, Ishida H Plant Signal Behav., 8(8): e25023, 2013
オートファジーシロイヌナズナベーシックスキャン基礎科学
Differential Metabolite Profiles during Fruit Development in High-Yielding Oil Palm Mesocarp.
Teh HF, Neoh BK, Hong MP, Low JY, Ng TL, Ithnin N, Thang YM, Mohamed M, Chew FT, Yusof HM, Kulaveerasingam H, Appleton DR PLoS One., 8(4): e61344, 2013
油を多く蓄積させるアブラヤシと少ししか蓄積しないアブラヤシを比較し、油を多く蓄積させるアブラヤシの代謝プロファイルを明らかにしている
アブラヤシマルチオミクス生産
Autophagy contributes to nighttime energy availability for growth in Arabidopsis.
Izumi M, Hidema J, Makino A, Ishida H Plant Physiol., 161(4): 1682-93, 2013
オートファジーシロイヌナズナ基礎科学
Profiling of metabolites in oil palm mesocarp at different stages of oil biosynthesis.
Neoh BK, Teh HF, Ng TL, Tiong SH, Thang YM, Ersad MA, Mohamed M, Chew FT, Kulaveerasingam H, Appleton DR J Agric Food Chem., 61(8): 1920-7, 2013
アブラヤシの代謝プロファイリングから、果実の発育中のアミノ酸、ヌクレオチド、およびTCA回路中間体の蓄積が明らかになった
アブラヤシ生産
ppGpp Controlled by the Gac/Rsm Regulatory Pathway Sustains Biocontrol Activity in Pseudomonas fluorescens CHA0
Takeuchi K, Yamada K, Haas D Mol Plant Microbe Interact, 25(11): 1440-9, 2012
ppGppバクテリアマルチオミクス
Metabolome analysis of photosynthesis and the related primary metabolites in the leaves of transgenic rice plants with increased or decreased Rubisco content.
Suzuki Y, Fujimori T, Kanno K, Sasaki A, Ohashi Y, Makino A Plant Cell Environ., 35(8): 1369-79, 2012
植物の光合成に関わるメタボローム解析を行い、光合成のキーとなる酵素の増減により代謝全体がどのように動くか明らかにした
RubiscoTCA回路イネ光合成
Atlas of rice grain filling-related metabolism under high temperature: joint analysis of metabolome and transcriptome demonstrated inhibition of starch accumulation and induction of amino acid accumulation.
Yamakawa H, Hakata M Plant Cell Physiol., 51(5): 795-809, 2010
高温ストレスがイネの種子登熟代謝に及ぼす影響をメタボローム解析とトランスクリプトーム解析を組み合わせて調べた
イネ生産
化学・環境分野の論文一覧
Cold-stress responses in the Antarctic basidiomycetous yeast Mrakia blollopis.
Masaharu Tsuji Royal Society Open Science, : , 2016

南極のような極限環境に生息している菌類は氷点下でも成長が可能であることから、このような地域における物質循環に大きな役割を果たしている。本研究では、低温での成長能の異なる南極産担子菌酵母Mrakia blollopisを用い、低温ストレスによる細胞内の代謝産物蓄積量の変化を調べてみた。低温での成長に優れたM. blollopis SK-4株は氷点下で細胞分裂や細胞壁合成などの代謝経路が活発になるほか、低温下での成長に関与する芳香族アミノ酸など生合成するのにATP を消費する物質を大量に生産していた。このことから、南極産菌類が氷点下で細胞を凍結させないために多大なコストを支払いながら成長していることを世界で初めて明らかにした。

ベーシックスキャン
Dynamic changes in the accumulation of metabolites in brackish water clam Corbicula japonica associated with alternation of salinity.
Koyama H, Okamoto S, Watanabe N, Hoshino N, Jimbo M, Yasumoto K, Watabe S Comp Biochem Physiol B Biochem Mol Biol., 181: 59-70, 2015
ヤマトシジミの代謝プロファイルは周囲の塩分濃度に応じて変化する
ベーシックスキャン筋肉魚介類
Metabolomic analysis reveals metabolic changes caused by bisphenol A in rats.
Chen M, Zhou K, Chen X, Qiao S, Hu Y, Xu B, Xu B, Han X, Tang R, Mao Z, Dong C, Wu D, Wang Y, Wang S, Zhou Z, Xia Y, Wang X. Toxicol Sci., 138(2): 256-67, 2014
化学物質bisphenol Aがラットの代謝に与える影響
ベーシックスキャンマルチオミクスラット尿毒性
Fermentation of Xylose Causes Inefficient Metabolic State Due to Carbon/Energy Starvation and Reduced Glycolytic Flux in Recombinant Industrial Saccharomyces cerevisiae.
Matsushika A, Nagashima A, Goshima T, Hoshino T PLoS One., 8(7): e69005, 2013
エネルギー代謝バクテリアベーシックスキャン生産
Effect of Bisphenol A on Rat Metabolic Profiling Studied by Using Capillary Electrophoresis Time-of-Flight Mass Spectrometry.
Zeng J, Kuang H, Hu C, Shi X, Yan M, Xu L, Wang L, Xu C, Xu G Environ Sci Technol., 47(13): 7457-65, 2013
化学物質bisphenol Aがラットの代謝に与える影響
ラット尿毒性
醗酵・生産分野の論文一覧
Different Polar Metabolites and Protein Profiles between High- and Low-Quality Japanese Ginjo Sake
Takahashi K, Kohno H. PLoS One., 11(3): e0150524, 2016
吟醸酒品質の優劣により極性代謝物質とタンパク質プロファイルが異なる
ベーシックスキャン酒類
Inhibitory role of Greatwall-like protein kinase Rim15p in alcoholic fermentation via upregulating the UDP-glucose synthesis pathway in Saccharomyces cerevisiae.
Watanabe D, Zhou Y, Hirata A, Sugimoto Y, Takagi K, Akao T, Ohya Y, Takagi H, Shimoi H. Appl Environ Microbiol., 82(1): 340-51, 2015
清酒酵母は、Rim15pプロテインキナーゼを介したUDP-グルコース合成経路の欠損により高いアルコール発酵力を獲得することを発見し、実用酵母菌株の高発酵力の原因を明らかにした。
ベーシックスキャンユーカリオート酵母
The respiratory chain provides salt stress tolerance by maintaining a low NADH/NAD+ ratio in Zymomonas mobilis.
Hayashi T, Kato T, Watakabe S, Song W, Aikawa S, Furukawa K. Microbiology., 161(12): 2384-94, 2015
エタノール発酵細菌Zymomonas mobilisの呼吸鎖は低いNADH/NAD+バランスを維持することで塩ストレス耐性を付与している。
バクテリアベーシックスキャン
Bacterial quorum sensing and metabolic slowing in a cooperative population.
An JH, Goo E, Kim H, Seo YS, Hwang I. Proc Natl Acad Sci U S A., 111(41): 14912-7, 2014
イネに感染するイネもみ枯細菌病菌(Burkholderia glumae)のクオラムセンシング(菌の生息密度によって、物質生産をコントロールする機構)と代謝の関連を明らかにした
バクテリア生産
Regulation of Primary Metabolic Pathways in Oyster Mushroom Mycelia Induced by Blue Light Stimulation: Accumulation of Shikimic Acid
Kojima M, Kimura N, Miura R. Sci Rep., 5: 8630, 2015
ヒラタケの一次代謝経路が光刺激により制御できることを示した
生産菌類
Fermentation of Xylose Causes Inefficient Metabolic State Due to Carbon/Energy Starvation and Reduced Glycolytic Flux in Recombinant Industrial Saccharomyces cerevisiae.
Matsushika A, Nagashima A, Goshima T, Hoshino T PLoS One., 8(7): e69005, 2013
エネルギー代謝バクテリアベーシックスキャン生産
Cytotoxic mechanism of selenomethionine in yeast.
Kitajima T, Jigami Y, Chiba Y. J Biol Chem., 287(13): 10032-8, 2012
酵母でのセレノメチオニンの細胞毒性メカニズム
バクテリア基礎科学
Depiction of metabolome changes in histidine-starved Escherichia coli by CE-TOFMS
Ohashi Y., Hirayama A., Ishikawa T., Nakamura S., Shimizu K., Ueno Y., Tomita M., and Soga T Mol. BioSyst., 4(2): 135-147, 2008
ヒスチジン欠乏下における大腸菌のメタボローム解析
バクテリアベーシックスキャン
化粧品・香料分野の論文一覧
Seasonal induction of alternative principal pathway for rose flower scent
Hirata H, Ohnishi T, Tomida K, Ishida H, Kanda M, Sakai M, Yoshimura J, Suzuki H, Ishikawa T, Dohra H, Watanabe N. Sci Rep., 6: 20234, 2016
バラが2-フェニルエタノールを作り出す二つの経路を季節に応じてシフトさせることを明らかにした
バラ育種
Suppression of Microbial Metabolic Pathways Inhibits the Generation of the Human Body Odor Component Diacetyl by Staphylococcus spp.
Hara T, Matsui H, Shimizu H PLoS One., 9(11): e111833, 2014
匂い成分の産生菌に対する天然増殖阻害成分のメカニズムを代謝解析から解明
エフ・スコープバクテリア