サービス一覧

サービス一覧

sp content nav HMTの発表論文・総説
C-SCOPE
シー・スコープ
シー・スコープはCE-QqQMSでしか検出できない中心代謝(エネルギー、アミノ酸、核酸代謝)の代謝変動を高感度・高精度に測定するメタボローム解析サービスです。
シー・スコープでは代謝物質の絶対濃度が得られるので、代謝物質同士のプールサイズを比較し、核酸のエネルギーチャージや機能別アミノ酸プール量などの代謝パラメーターを算出することが可能です。
主な用途 エネルギー代謝が注目されるメカニズム解析
長期にわたって安定的な分析が求められる研究
解析対象 中心エネルギー代謝に含まれる116物質
解糖系/糖新生、TCAサイクル、ペントースリン酸経路、脂質代謝、アミノ酸代謝、核酸代謝など
検出物質数*1 血液、培地:50 ~ 80
動植物組織 :90 ~
培養細胞: 90 ~
対象試料 動物組織(肝臓、筋肉、脳)、培養細胞、動物血液、培地、培養微生物細胞(酵母、大腸菌)
報告値 試料中濃度
30項目の代謝パラメーター
報告書 分析対象の116代謝物質について試料中濃度、30項目の代謝パラメーター、統計解析(PCA・ヒートマップ)結果およびパスウェイマッピングを報告
統計解析・
パスウェイ解析*2
無料
納品までの目安期間 20~60日
オプションをご覧になりたい方はこちら
*1 解析試料種や条件によって結果は異なります。
*2 追加解析は有料となります。
代謝パラメーターとはどんなものですか?
ご報告する代謝パラメーターは、細胞内エネルギー状態の指標となるアデニル酸エネルギーチャージや、肝臓機能の指標となるフィッシャー比、ミトコンドリア機能の指標となるLP比、各種アミノ酸総量などで、これらのパラメーターは生体機能や代謝状態を反映しています。代謝物質の絶対量(濃度)が得られて初めて算出することができるものです。
濃度が分かるとどんなメリットがあります か?
濃度が分かることにより
・異なる物質間での比較
・異なる物質同士の加減
・異なるバッチで分析した試験データの比較
が可能になります。これにより、代謝パラメーターを算出したり、過去の試験 データと統合をすることができます。
CE-QqQMSはCE-TOFMSに比べて感度はどのくら い違うのですか?
ターゲットを絞って分析することにより、物質によりますが10倍から1000倍感度 が上がります。
PATHWAY NAME ABBR KEGG ID HMDB ID
Amino acid 2-Oxoisovaleric acid C00141 HMDB00019
Amino acid Alanine Ala C00041.C00133.C01401 HMDB00161.HMDB01310
Amino acid Arginine Arg C00062.C00792 HMDB00517.HMDB03416
Amino acid Asparagine Asn C00152.C01905.C16438 HMDB00168
Amino acid Asparaginic acid Asp C00049.C00402.C16433 HMDB00191.HMDB06483
Amino acid Carnosine Carnosine C00386 HMDB00033
Amino acid Cystathionine C00542,C02291 HMDB00099
Amino acid Cysteine Cys C00097.C00736.C00793 HMDB00574.HMDB03417
Amino acid Glutamic acid Glu C00025.C00217.C00302 HMDB00148.HMDB03339
Amino acid Glutamine Gln C00064.C00303.C00819 HMDB00641.HMDB03423
Amino acid Glycine Gly C00037 HMDB00123
Amino acid Histidine His C00135.C00768.C06419 HMDB00177
Amino acid Homocysteine C00155,C05330 HMDB00742
Amino acid Homoserine C00263 HMDB00719
Amino acid Hydroxyproline C01015.C01157 HMDB06055.HMDB00725
Amino acid Isoleucine Ile C00407.C06418.C16434 HMDB00172
Amino acid Leucine Leu C00123.C01570.C16439 HMDB00687
Amino acid Lysine Lys C00047.C00739.C16440 HMDB00182.HMDB03405
Amino acid Methionine Met C00073.C00855.C01733 HMDB00696
Amino acid N-Acetylglutamic acid C00624 HMDB01138
Amino acid Phenylalanine Phe C00079.C02057.C02265 HMDB00159
Amino acid Proline Pro C00148.C00763.C16435 HMDB00162.HMDB03411
Amino acid S-Adenosylhomocysteine SAH C00021
Amino acid S-Adenosylmethionine SAM C00019 HMDB01185
Amino acid Serine Ser C00065.C00716.C00740 HMDB00187.HMDB03406
Amino acid Threonine Thr C00188.C00820 HMDB00167
Amino acid Tryptophan Trp C00078.C00525.C00806 HMDB00929
Amino acid Tyrosine Tyr C00082.C01536.C06420 HMDB00158
Amino acid Valine Val C00183.C06417.C16436 HMDB00883
Amino acid γ-Aminobutyric acid GABA C00334 HMDB00112
Choline Betaine C00719 HMDB00043
Choline Betaine aldehyde C00576 HMDB01252
Choline Choline C00114 HMDB00097
Choline N,N-Dimethylglycine DMG C01026 HMDB00092
Choline Sarcosine C00213 HMDB00271
Coenzyme Coenzyme A CoA C00010 HMDB01423
Coenzyme Nicotineamide adenine dinucleotide
(oxidized form)
NAD+ C00003 HMDB00902
Coenzyme Nicotineamide adenine dinucleotide
(reduced form)
NADH C00004
Coenzyme Nicotineamide adenine dinucleotide phosphate
(oxidized form)
NADP+ C00006 HMDB00217
Coenzyme Nicotineamide adenine dinucleotide phosphate
(reduced form)
NADPH C00005
Coenzyme β-Alanine β-Ala C00099 HMDB00056
Energy Adenosine 5-diphosphate ADP C00008 HMDB01341
Energy Adenosine 5-monophosphate AMP C00020 HMDB00045
Energy Adenosine 5-triphosphate ATP C00002 HMDB00538
Energy Guanosine 5-diphosphate GDP C00035 HMDB01201
Energy Guanosine 5-monophosphate GMP C00144 HMDB01397
Energy Guanosine 5-triphosphate GTP C00044 HMDB01273
Fatty acid Acetoacetyl coenzyme A Acetoacetyl-CoA C00332 HMDB01484
Fatty acid Carnitine C00318.C00487
Fatty acid Malonyl coenzyme A Malonyl-CoA C00083 HMDB01175
Folate Folic acid C00504 HMDB00121
Glutathione Glutathione (oxidized form) GSSG C00127 HMDB03337
Glutathione Glutathione (reduced form) GSH C00051 HMDB00125
Glycogen Fructose 1-phosphate F1P C01094,C02976 HMDB01076
Glycogen Galactose 1-phoshate Gal1P C00446 HMDB00645
Glycogen UDP-glucose C00029 HMDB00286
Glycolysis 2,3-Diphosphoglyceric acid C01159 HMDB01294
Glycolysis 2-Phosphoglyceric acid 2PG C00631 HMDB03391
Glycolysis 3-Phosphoglyceric acid 3PG C00197 HMDB00807
Glycolysis Acetyl coenzyme A Acetyl-CoA C00024 HMDB01206
Glycolysis Dihydroxyacetone phosphate DHAP C00111 HMDB01473
Glycolysis Fructose 1,6-diphosphate F1,6BP C00354 HMDB01058
Glycolysis Fructose 6-phosphate F6P C00085 HMDB00124
Glycolysis Glucose 1-phosphate G1P C00103 HMDB01586
Glycolysis Glucose 6-phosphate G6P C00092 HMDB01401
Glycolysis Glyceraldehyde 3-phosphate G3P C00118,C00661 HMDB01112
Glycolysis Glycerol 3-phosphate Gly3P C00093 HMDB00126
Glycolysis Lactic acid C00186.C00256.C01432 HMDB00190.HMDB01311
Glycolysis Phosphoenolpyruvic acid PEP C00074 HMDB00263
Glycolysis Pyruvic acid C00022 HMDB00243
Glyoxylate cycle Glycolic acid C00160 HMDB00115
Glyoxylate cycle Glyoxylic acid C00048 HMDB00119
Pentose-P 6-Phosphogluconic acid 6PG C00345 HMDB01316
Pentose-P Erythrose 4-phosphate E4P C00279 HMDB01321
Pentose-P Phosphoribosyl pyrophospate PRPP C00119 HMDB00280
Pentose-P Ribose 1-phosphate C00620 HMDB01489
Pentose-P Ribose 5-phosphate R5P C00117 HMDB01548
Pentose-P Ribulose 5-phosphate Ru5P C00199.C01101 HMDB00618
Pentose-P Sedoheptulose 7-phosphate S7P C05382 HMDB01068
Pentose-P Xylulose 5-phosphate C00231,C03291 HMDB00868
Polyamine Purtrescine C00134 HMDB01414
Polyamine Spermidine C00315 HMDB01257
Polyamine Spermine C00750 HMDB01256
Purine Adenine C00147 HMDB00034
Purine Adenosine C00212 HMDB00050
Purine Adenylosuccinic acid C03794 HMDB00536
Purine ADP-ribose C00301 HMDB01178
Purine Hypoxanthine C00262 HMDB00157
Purine Inosine C00294 HMDB00195
Purine Inosine 5-monophosphate IMP C00130 HMDB00175
Purine Uric acid C00366 HMDB00289
Purine Xanthine C00385 HMDB00292
Purine Xanthosine 5-monophosphate XMP C00655 HMDB01554
Pyrimidine Carbamoyl aspartic acid C00438 HMDB00828
Pyrimidine Guanine C00242 HMDB00132
Pyrimidine Guanosine C00387 HMDB00133
Signal Cyclic adenosine 5-monophosphate cAMP C00360 HMDB00905
Signal Cyclic guanosine 5-monophosphate cGMP C00942 HMDB01314
Steroid Hydroxymethylglutaroyl coenzyme A HMG-CoA C00356 HMDB01375
Steroid Mevalonic acid C00418,C02104 HMDB00227
TCA cycle 2-Hydroxyglutaric acid C01087.C02630.C03196
TCA cycle 2-Oxoglutaric acid αKG C00026 HMDB00208
TCA cycle cis-Aconitic acid C00417 HMDB00072
TCA cycle Citric acid C00158 HMDB00094
TCA cycle Fumaric acid C00122 HMDB00134
TCA cycle Isocitric acid C00311 HMDB00193
TCA cycle Malic acid C00149.C00497.C00711 HMDB00156.HMDB00744
TCA cycle Succinic acid C00042 HMDB00254
Urea Argininosuccinic acid C03406 HMDB00052
Urea Carbamoyl phosphate C00169
Urea Citrulline C00327 HMDB00904
Urea Creatine C00300 HMDB00064
Urea Creatinine C00791 HMDB00562
Urea Ornithine C00077.C00515.C01602 HMDB00214.HMDB03374
Urea Phosphocreatine C02305 HMDB01511
Urea Urea C00077.C00515.C01603 HMDB00214.HMDB03375
    代謝物質名にはシノニムがある可能性があります。代謝物質名でリストされていない場合に、KEGG IDもしくはHMDB IDで検索していただくとリストされているかもしれません。

  • KEGG IDを調べる >> DBGET Search – COMPOUND
  • HMDB IDを調べる >> HMDB Browse
  • 検索窓に任意の代謝物質名を記入して"Go"もしくは"Search"をクリックしてください。
C-SCOPE を利用してこんな論文が発表されています
Cerebrospinal fluid metabolomics identifies a key role of isocitrate dehydrogenase in bipolar disorder: evidence in support of mitochondrial dysfunction hypothesis.
Yoshimi N, Futamura T, Bergen SE, Iwayama Y, Ishima T, Sellgren C, Ekman CJ, Jakobsson J, Pålsson E, Kakumoto K, Ohgi Y, Yoshikawa T, Landén M, Hashimoto K. Mol Psychiatry., : , 2016
双極性障害におけるイソクエン酸脱水素酵素(ICDH)の主要な役割を明らかにした
CSFシー・スコープラット精神疾患
Metabolic analysis of antibody producing Chinese hamster ovary cell culture under different stresses conditions.
Badsha MB, Kurata H, Onitsuka M, Oga T, Omasa T. J Biosci Bioeng., : , 2016
培養細胞による抗体産生で生産性の違いを代謝モデルで解析した
シー・スコープ培養細胞抗体
Hepatocyte β-Klotho regulates lipid homeostasis but not body weight in mice.
Kobayashi K, Tanaka T, Okada S, Morimoto Y, Matsumura S, Manio MC, Inoue K, Kimura K, Yagi T, Saito Y, Fushiki T, Inoue H, Matsumoto M, Nabeshima Y. FASEB J., 30(2): 849-62, 2016
肝細胞β-Klotho依存的胆汁酸合成制御は、脂質恒常性に必須であるが、体重制御には寄与しない
シー・スコープマウス血漿
シー・スコープに関する論文一覧はこちら