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sp content nav HMTの発表論文・総説
F-SCOPE
エフ・スコープ
エフ・スコープは安定同位体ラベル解析を行っていただける新しい受託解析サービスです。
13Cでラベルされた代謝物質をを解析することで、代謝経路ごとの活性の増減やその反応方向を決定的に提示します。
主な用途 エネルギー代謝におけるラベル解析
解析対象 解糖系/糖新生、TCAサイクル、ペントースリン酸経路などの30代謝物質

[解糖系/糖新生]
G1P, G6P, F6P, F1,6BP, GAP, DHAP, 3PG, 2PG, PEP, Pyruvic acid, Lactic acid,
[TCA回路]
Citric acid, cis-Aconitic acid, Isocitric acid, 2OG, Succinic acid, Fumaric acid, Malic acid
[ペントースリン酸回路]
6PG, Rib5P, R5P, E4P, S7P, PRPP
[その他]
AcCoA, CoA, 3HB, AMP, ADP, ATP

またはそれらにアミノ酸など24代謝物質を加えた54代謝物質

[アミノ酸]
Ala, Arg, Asp, Asn, Glu, Gln, Gly, His, Ile, Leu, Lys, Met, Phe, Pro, Ser, Thr, Trp, Val, Cys, Tyr
[尿素回路]
Citrulline, Ornithine
[その他]
GSH, GSSG
対象試料 動物培養細胞・微生物培養細胞・培地・動物組織など
報告値 全ピークおよび各物質総和の相対面積値
各物質総和の試料中濃度 (1点検量)
報告書 検出されたピークおよび各代謝物質総和*2の相対面積値、各物質総和の試料中濃度およびパスウェイマッピングを報告
統計解析・
パスウェイ解析*1
無料 (パスウェイに各物質の総量とモノアイソトピックイオンの相対面積値を表示)
ラベル 13C
納品までの目安期間 20~60日
オプションをご覧になりたい方はこちら
*1 追加解析は有料となります。
*2 各代謝物質の同位体イオンの和
同位体ラベル解析とは何ですか?
自然界に一般的に存在するものとは異なる質量を持つ原子を同位体といいます。同位体を含む基質が代謝されて別の物質に変換されても同位体はそのまま残るため、同位体を「ラベル」として扱うことができます。 質量分析計は同位体を区別することができるため、同位体をラベルとして基質がどの代謝経路を通って何に変換されているかが解析できます。
どのような試料でも解析できますか?
解析対象試料に制限はございませんが、同位体ラベル解析は、ラベルされた基質を対象試料に効率よく取り込ませる必要があるため、細胞(動植物・微生物)を用いた研究において、細胞や培地を対象として行うのが一般的です。また、モデル動物にラベルされた基質を餌として与えることも可能です。
どんなラベルでも使用できますか?
F-SCOPEでは13Cのみを解析対象としていますが、13Cを使用した基質試薬であればどのメーカーのものをお使いいただいてもかまいません。
F-SCOPE を利用してこんな論文が発表されています
Signaling through the Phosphatidylinositol 3-Kinase (PI3K)/Mammalian Target of Rapamycin (mTOR) Axis Is Responsible for Aerobic Glycolysis mediated by Glucose Transporter in Epidermal Growth Factor Receptor (EGFR)-mutated Lung Adenocarcinoma.
Makinoshima H, Takita M, Saruwatari K, Umemura S, Obata Y, Ishii G, Matsumoto S, Sugiyama E, Ochiai A, Abe R, Goto K, Esumi H, Tsuchihara K. J Biol Chem., 290(28): 17495-504, 2015
EGFR遺伝子変異肺線がん細胞においてPI3K/AKT/mTOR系のシグナル伝達は好気的解糖の調節に不可欠である
がんエフ・スコープシー・スコープ培養細胞
Suppression of Microbial Metabolic Pathways Inhibits the Generation of the Human Body Odor Component Diacetyl by Staphylococcus spp.
Hara T, Matsui H, Shimizu H PLoS One., 9(11): e111833, 2014
匂い成分の産生菌に対する天然増殖阻害成分のメカニズムを代謝解析から解明
エフ・スコープバクテリア
Metabolomic profiling rationalized pyruvate efficacy in cybrid cells harboring MELAS mitochondrial DNA mutations.
Kami K, Fujita Y, Igarashi S, Koike S, Sugawara S, Ikeda S, Sato N, Ito M, Tanaka M, Tomita M, Soga T Mitochondrion., 12(6): 644-53, 2012
エネルギー代謝エフ・スコープ
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