代謝物質検索

代謝物質の情報を見るには、代謝物質名をクリックするだけです。MeTaBoardのトップページには登録された代謝物質すべてが表示されています。

MeTaBoardに登録された数多くの代謝物質の中から目的の代謝物質を見つけるには4つのの方法があります。

Initial letters
頭文字から絞り込む

initial Letters調べたい代謝物質の名前が分かっている場合は、頭文字で絞り込むことができます。ページ右上に"頭文字から絞り込む"という欄があります。調べたい代謝物質の頭文字をクリックすると、リストを絞り込むことができます。

ヒント1

頭文字はどれだろう?と迷う必要はありません。たとえば、cis-Aconitic acidであれば、AとC両方に登録されています。とにかくこれだと思った頭文字をクリックしてみましょう。

ヒント2

ここで絞り込めるのは、HMTのアノテーションリストに登録されている名前です。例えばイソクエン酸なら、IUPACの「1-hydroxypropane-1,2,3-tricarboxylic acid」ではなく、Isocitric acidで登録されているので、Iから絞り込んでください。

Keyword(s)
キーワードで検索する

searchingページ右上の検索ウインドウにキーワードを入力し、検索ボタンをクリックすると、入力されたキーワードに関係のある代謝物質が表示されます。キーワードは代謝物質名、PMID、生物種などなんでもかまいません。

ヒント1

検索の対象となるのは代謝物質名だけではありません。キーワードに関係のある代謝物質がすべて表示されます。

ヒント2

代謝物質には様々な呼び方があります。なるべくたくさんの名前を登録するようにしていますが、もしお探しの名前で登録されていなかった場合でも、別の名前で登録されていることもあります。
MeTaBoardにはPubChemHMDBKEGGのIDが登録されていますので、もし特定の代謝物質をお探しの場合は、一意に決まるこれらのIDで検索するのが一番確実です。

Classifications
分類から絞り込む

それぞれの代謝物質には、代謝経路・分子構造・検出試料・生理活性の情報が登録されています。 category ページ上部のタブのMenu↓をクリックすると、スライドパネルが表示されます(スライドパネルの使い方についてはスライドパネルをご覧ください)。スライドパネルのリンクをクリックすると、分類された代謝物質だけが一覧になって表示されます。 ある代謝経路の代謝物質のリストを得たい場合や、ある試料からどんな代謝物質が検出されるのかを知りたい場合などに便利です。

Subway map-like Pathway Map
パスウェイマップから探す

Internet Exproler以外のブラウザをご利用の方は、パスウェイマップから目的の代謝物質を探していただけます。代謝物質名は、各代謝物質のページにリンクしています。前後の代謝物質を確認しながら代謝物質情報を得るのに便利です。

パスウェイマップを表示する


・大きい丸はコアスコープおよびエナジースコープで分析する代謝物質、小さい丸はエナジースコープのみで分析する物質を表しています。
・パスウェイマップは代謝を便宜的に表示したものであり、生体内の代謝経路を正確に表すものではありません。
・JavascriptおよびHTML5 canvasの機能を利用しブラウザにより描画しています。読み込みに時間がかかることがあり、HTML5に準拠していないInternet Exprolerではご覧いただけません。

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