メタブローグ
プロテオミクス
【研究者インタビュー】東京大学総括プロジェクト機構 総括寄付講座「食と生命」加藤久典特任教授
今回は、東京大学総括プロジェクト機構 総括寄付講座「食と生命」で栄養と体の関係について研究をしておられる加藤久典先生にお話を伺いました。加藤先生の研究室には、2011年にHMTメタボロミクス研究助成を受賞された高橋祥子さん（コーヒー摂取による抗肥満・抗糖尿病効果の作用機序に関するメタボロミクスを用いた系統的検討）も所属していらっしゃいます。
―まず初めに、先生のご研究について簡単に説明していただけますか？…
[第3回マルチオミクス] 超多重リン酸化修飾のナゾ
バイオメディカルグループの篠田です。以前のメタブローグで、昨今のリン酸化プロテオミクスのめざましい進展にともない、タンパク質のリン酸化修飾サイトが、これまでの予想より広汎に存在することがわかってきたが、その意義は未解明である、と紹介しました。
上記の傾向は、高等生物になるほど顕著で、原核生物では、１つのタンパク質につき７個以上のリン酸化修飾（セリン、スレオニン、チロシン）のサイトが存在することは非常に稀ですが、真核生物では、１つのタンパク質につき150サイト以上も珍しくありません。
今回、その「超多重リン酸化」の生物的意義の一端をシステムズバイオロジーの手法で解明した論文が、ハーバード大学のグループから出たので、紹介します。…
[第2回マルチオミクス] プロテオミクス技術はどのくらいのタンパク質を明らかにするか？
バイオメディカルグループの篠田です。マルチオミクスシリーズ第三弾として、プロテオミクスについて取り上げます。
質量分析計の発達により、一度に数千個のタンパク質を同定した論文が普通になり、さらにSILAC法を代表とする、複数種類の安定同位体アミノ酸を培養細胞に取り込ませピークを比較する方法で、定量的解析もできるようになりました。ノンコーディングRNAもあるとは言え、タンパク質が生命システムの主役であることを考えると、すでに我々は生命の部品カタログの完成に近づいているように思えますが、実際のところはどうなのでしょうか？ 最新の論文から、プロテオミクス技術でどのくらいのタンパク質が見えるのか、まとめてみました。…